Patří ke špičkám české i světové fyzioterapie. Profesor Pavel Kolář se dlouhodobě věnuje především pohybové patologii dětí, mezi veřejností je ale známější díky své fyzioterapeutické péči o vrcholové sportovce – Jaromíra Jágra, Romana Šebrleho, Radka Štěpánka a řadu dalších – nebo zpěváky Helenu Vondráčkovou či Jiřího Korna. Byl také členem lékařského konsilia bývalého prezidenta Václava Havla.
Kineziologií se zabýval už v době studia. Od roku 1999 je přednostou Kliniky rehabilitace a tělovýchovného lékařství fakultní nemocnice v Motole a 2. Lékařské fakulty Univerzity Karlovy, kde je momentálně také proděkanem pro rozvoj a investice. Přednáší na českých i zahraničních univerzitách, velmi aktivně se věnuje publikační činnosti a vystupuje v médiích. Zároveň je členem realizačních týmů české sportovní reprezentace v hokeji, fotbale, atletice a dalších disciplínách.
Pavel Kolář je autorem více než 140 odborných článků a několika úspěšných knih, například Rehabilitace v klinické praxi, Posilování stresem nebo Labyrint pohybu. Je zakladatelem diagnostického a terapeutického konceptu Dynamická neuromuskulární stabilizace (DNS), který se používá ve fyzioterapii, ale i příbuzných medicínských oborech k diagnostice a cílené optimalizaci pohybové úrovně jedince. V roce 2007 obdržel z rukou prezidenta Václava Klause státní vyznamenání Za zásluhy o stát v oblasti výchovy a vědy.