Věnuje se zejména využití všímavosti a soucitu se sebou v psychoterapii a seberozvoji. Dlouhodobě se zajímá také o meditaci, buddhistickou psychologii a změněné stavy vědomí.
Jan Benda provozuje soukromou psychologickou praxi v Ústí nad Labem. Rád cestuje do jihovýchodní Asie, nějakou dobu žil i jako buddhistický mnich na Srí Lance. Je autorem knihy Všímavost a soucit se sebou: Proměna emocí v psychoterapii.